Минерально-сырьевая база республики, определяемая её геологическим строением, представлена месторождениями и проявлениями нерудного сырья, используемого преимущественно в производстве строительных материалов, а также месторождениями торфа, сапропеля и лечебных грязей.
На территории Республики Марий Эл зарегистрировано более 1000 месторождений и проявлений полезных ископаемых по следующим видам минерального сырья: гипс, ангидрит; цементное сырье (глина, известняк); камень строительный; для известкования почв; для производства извести; кирпично-черепичное сырье; керамзитовое сырье; глина для буровых растворов; стекольное сырье (песчаное, карбонатное); формовочные пески; пески для строительных работ; песчано-гравийные смеси; торф; сапропель; лечебные грязи; вода пресная и вода минеральная.
Балансом запасов на территории Республики Марий Эл по состоянию на 01.01.2018 г. учтено:
– 13 месторождений необщераспространённых (федерального значения) твердых полезных ископаемых по 3 видам сырья – стекольное, цементное и грязи лечебные;
– 79 месторождений общераспространенных твердых полезных ископаемых по 8 видам сырья, применяемого в основном для ведения строительных работ;
– 138 торфяных месторождений площадью более 10 га;
– 22 месторождения сапропеля площадью более 3 га. 
Месторождения полезных ископаемых
Подземные воды. Разведаны 42 месторождения пресных подземных вод и 4 месторождения лечебных минеральных подземных вод – Кленовогорское, Сурокское и Сосновоборское. На последних запасы подземных вод, приуроченные к отложениям казанского яруса (Кленовогорское, Сурокское и Сосновоборское), утверждены в качестве питьевых лечебно-столовых вод, а запасы подземных вод, залегающих в интервале от нижнепермских до среднекаменноугольных отложений (Кленовогорское месторождение), утверждены как бальнеологические воды (рассолы).
Цементное сырьё. В республике разведано и оценено 6 месторождений цементного сырья, из которых балансом запасов учтены 3 месторождения – Чукшинское-1 карбонатных пород, Северочукшинское глинистых пород и Каменногорское месторождение карбонатных пород, в северной части которого разведана залежь суглинков, пригодных в качестве глинистой составляющей цементного сырья, в связи с чем месторождение рассматривается как комплексное – карбонатное + глинистое. Все месторождения расположены в восточной части республики на территории Моркинского района и стратиграфически приурочены к отложениям казанского яруса, обнажающимся в центральной части Шургинского поднятия Марийско-Вятского увала. Оценка запасов выполнена по категориям С1+С2. Суммарные запасы цементного сырья: С1 – 20945 тыс. т, С2 – 21467 тыс. т.
Примечание: при оценке запасов полезных ископаемых выделяют категории: «А» – детально разведанные запасы полезных ископаемых; «В» – предварительно разведанные запасы полезных ископаемых; «C1» – запасы разведанных месторождений сложного геологического строения и слабо разведанные запасы полезных ископаемых; «C2» – перспективные, неразведанные запасы.
Стекольное сырьё представлено 5 месторождениями стекольных песков, учтённых балансом запасов и 2 месторождениями известняков, учтённых только государственным кадастром месторождений. Суммарные запасы стекольных песков, учтённые балансом запасов, составляют 14787 тыс. т. Наиболее крупным и имеющим выгодное географическое расположение является Бушковское месторождение, пески которого могут использоваться и в качестве формовочных материалов в литейном производстве. Бушковское месторождение считается подготовленным к промышленному освоению – количество запасов составляет: стекольные пески: кат. В+С1 – 7041 тыс. т, кат. С2 – 1578 тыс. т., в т. ч. пригодные в качестве формовочных: кат. В+С1 – 3642 тыс. т, С2 – 1578 тыс. т.
Лечебные грязи. Балансом запасов лечебных грязей в республике учтено 5 месторождений с балансовыми запасами категории А – 227,6 тыс. м3, расположенных в пойме реки Илети на территориях Волжского и Звениговского районов. По составу лечебные грязи соответствуют илам и сапропелям, образование которых происходило в условиях старичных озёр р. Илети. Месторождения небольшие, с запасами от 3,8 до 164,0 тыс. м3. Грязи отличаются тонким механическим составом (преобладает фракция 0,01-0,005), низкой засоренностью, хорошими пластическими свойствами, относятся к сильно сульфидному иловому минеральному типу. По эффективности результатов лечения не уступают грязям одесских лиманов. Особенно эффективны для лечения заболевания суставов, периферической нервной системы (радикулиты, невриты), гинекологии и др.
Гипс и ангидрит. В резерве на геологическое изучение числится Чукшинское-2 месторождение гипсо-ангидритового сырья с запасами гипса категории С1 – 15319 тыс. т, С2 – 35208 тыс. т. и суммарными прогнозными ресурсами категории С1 гипса и ангидрита – 175562 тыс. т. Месторождение расположено в наиболее приподнятой части Шургинского вала и залегает стратиграфически ниже карбонатных пород месторождения Чукшинское-1, разрабатываемого для получения строительного щебня и бута. Характеризуется сложным геологическим строением. Продуктивная толща не обводнена.
Пески для строительных работ составляют основной объём (70%) добываемых полезных ископаемых в республике. В связи с геологическим строением месторождения песков по запасам и качеству распространены в республике неравномерно. Наиболее крупные месторождения с песками, отвечающими требованиям промышленности по содержанию глинистых примесей, разведаны в центральной и юго-западной частях республики, в пределах Марийской низменности с большими мощностями четвертичных отложений. Всего в республике разведано и учтено территориальным балансом запасов 42 месторождения песчаного сырья с суммарными запасами категорий А+В+С1 – 99444 тыс. м3, С2 – 9683 тыс. м3. В распределённом фонде находится 35 месторождений с запасами категорий А+В+С1 – 94157 тыс. м3, С2 – 7483 тыс. м3. Пески в основном тонко-мелкозернистые. Основное их назначение – приготовление строительных растворов, бетонов, асфальтобетонных смесей, дорожное строительство. Пески Кундышского месторождения с запасами категорий А+В+С1 – 6949 тыс. м3 используются для производства силикатного кирпича.
Глины и суглинки на территории республики по минеральному составу относятся к легкоплавкому сырью и разведаны преимущественно в качестве керамического сырья для производства стеновой керамики, в меньшем объёме для производства керамзита и цемента. Основным видом сырья для стеновой керамики являются четвертичные элювиально-делювиальные суглинки мощностью от 1,0 м до 8,7 м, залегающие в кровле четвертичных отложений преимущественно в северо-восточной и правобережной частях республики. Аналогичные суглинки разведаны на 2 месторождениях и в качестве глинистой составляющей цементного сырья. Для получения керамзита используются глины монтмориллонитового состава неогенового возраста, залегающие в кровле и бортовых частях палеодолины реки Волги. Всего в республике балансом запасов учтено 16 месторождений кирпично-черепичного сырья с запасами категорий А+В+С1 – 30703 тыс. м3 и 2 месторождения керамзитового сырья с запасами категорий А+В+С1 – 5640 тыс. м3. В распределённом фонде находятся 3 месторождения. Основная добыча сырья для производства красного керамического кирпича ведётся на Ошургинском месторождении в Медведевском районе, запасы которого составляют 4930 тыс. м3 категории А+В+С1. Керамзитовое сырьё добывается на Кабачинском месторождении с запасами сырья – 2784 тыс. м3.
Карбонатные породы для производства щебня, бута, извести и известняковой муки. Балансом запасов в республике учтено 18 месторождений карбонатных пород, представленных известняками и доломитами, качество которых позволяет использовать их для производства щебня и бута, а также для получения муки для известкования почв и извести. Все они приурочены к выходам на поверхность верхнеказанских известняков, обнажающихся в сводовых частях валообразных поднятий на территории Советского, Новоторъяльского, Куженерского, Моркинского и Волжского районов. В распределённом фонде находятся 9 месторождений, в т. ч. 8 – камня строительного и 1 – для получения известняковой муки. Добыча ведется на 7 месторождениях строительного камня – Новоторъяльском, Чукшинском-1, Памашьяльском, Чодраяльском, Коркатовском, Юрдурском, Испаринск-1 и Ронгинском месторождении сырья для производства известняковой муки. Месторождения известняка для получения извести – Шуледурское и Чукшинское с суммарными запасами категорий А+В+С1 – 738 тыс. м3 балансом запасов учтены как резервные.
Торф. Торфяной фонд республики состоит из 566 месторождений и проявлений торфа с общими ресурсами 195,8 млн. т, в т. ч. 202 месторождения с запасами категорий А+В+С1+С2, что составляет 78,8 % от общих торфяных ресурсов. Основные запасы торфа (180,5 млн. т. – 92,2%) сосредоточены в 6 районах республики: Килемарском – 84,2 млн. т. (43,0%), Горномарийском – 29,7 млн. т. (15,2%), Юринском – 20,9 млн. т. (10,7%), Звениговском – 19,5 млн. т. (10,0%), Парангинском – 16,3 млн. т. (8,3 %), Медведевском – 9,9 млн. т. (5,1%). К числу наиболее крупных торфяных месторождений относятся: Шамьяро-Куплонгский массив – 8426 га (с запасами 17789 тыс. т), Вышкар-Куп – 1183 га (2107 тыс. т.), Ударное (Лешачье) – 1514 га (6430 тыс. т), Вален-Куп – 1821 га (7288 тыс. т.) и др. Основные запасы торфа сосредоточены на сравнительно ограниченном количестве торфяных месторождений размером более 300 га. Таких торфяных месторождений 40 (9,0%), а запасы торфа на них составляют 152,6 млн. т. (77,9%). Балансом запасов торфа учтено 138 месторождений площадью в границе промышленной глубины более 10 га с общими балансовыми запасами торфа при условной 40% влаге – 114094 тыс. т. Разрабатываются 4 месторождения с балансовыми запасами торфа категории А – 14327 тыс. т.
Сапропель. В республике зарегистрированы 23 месторождения и 47 проявлений сапропеля. Балансом запасов учтены 22 месторождения и 30 проявлений с общими ресурсами (запасами) 9328 тыс. т. Общий геологический запас сапропеля при условной 60% влажности – 5312 тыс. т, в том числе балансовые запасы по 22 месторождениям площадью более 3 га – 2457 тыс. т (46,3% от общих запасов). В группе разрабатываемых числится Водозерское месторождение.